Nouveau contenu sur le web avec cette dénomination :Une nouvelle technologie cartographie les interactions ADN-protéine unicellulaire
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Une nouvelle technologie permet aux scientifiques de cartographier, dans des cellules individuelles, les sites de liaison à l’ADN des facteurs de transcription et d’autres protéines régulatrices qui contrôlent l’activité des gènes, selon une étude menée par des chercheurs du Weill Cornell Medicine et du New York Genome Center. Présentant des avantages clés par rapport aux méthodes actuellement utilisées, cette technologie devrait constituer un ajout puissant à la boîte à outils des biologistes pour étudier les cellules en bonne santé et en maladie.
« D&D-seq », comme on appelle la nouvelle méthode, utilise des anticorps pour rapprocher une enzyme éditant l’ADN d’une protéine cible, permettant ainsi aux chercheurs d’enregistrer l’endroit où cette protéine interagit avec l’ADN. L’étude décrivant la technique, publiée le 4 juin dans Cell, a montré qu’elle surmonte les principaux inconvénients techniques des méthodes actuelles de cartographie des interactions protéine-ADN, et qu’elle est la première du genre à pouvoir être facilement intégrée dans des flux de travail « multi-omiques » à haut débit et unicellulaires.
« De nombreuses recherches ont été retardées parce que nous n’avions pas les bons outils pour cartographier les interactions ADN-protéines dans des cellules individuelles ; et maintenant que nous disposons d’un tel outil, il y a un énorme enthousiasme : c’est vraiment une avancée technologique fondamentale », a déclaré le co-auteur principal de l’étude, le Dr Dan Landau, professeur de médecine de la famille Bibliowicz et membre du Sandra et Edward Meyer Cancer Center et de l’Englander Institute for Precision Medicine à Weill Cornell. Le Dr Landau est également un membre principal du corps professoral du New York Genome Center.
L’autre co-auteur principal de l’étude est le Dr Ivan Raimondi, biologiste moléculaire principal et directeur de l’innovation en recherche au laboratoire Landau. Wei-Yu Chi, doctorant à la Weill Cornell Graduate School of Medical Sciences et le Dr Sang-Ho Yoon, associé postdoctoral en médecine au laboratoire de Landau, sont les co-premiers auteurs de l’article.
La multi-omique fait référence à des analyses combinées de différentes couches d’informations au sein des cellules, notamment les séquences d’ADN (génomes), les modèles d’activité génique (transcriptomes) et les populations de protéines (protéomes). Ce qu’on appelle parfois le régulome couvre les facteurs de transcription et d’autres protéines qui se lient à l’ADN pour activer ou désactiver les gènes.
Ces protéines régulatrices sont connues pour leur importance cruciale en biologie. Une grande partie des points chauds à risque de maladie identifiés dans les études génétiques se situent au niveau des sites de liaison des facteurs de transcription. Pourtant, les outils disponibles pour cartographier les événements réels de liaison à l’ADN des facteurs de transcription dans les cellules, y compris les cellules primaires prélevées sur des patients, présentent des limites importantes. Ceux-ci incluent une insensibilité relative aux événements de liaison faibles ou transitoires, et une incompatibilité avec d’autres outils multi-omiques standards, une incompatibilité qui peut rendre difficile une vue d’ensemble de la façon dont un gène ou un réseau de gènes est régulé.
D&D-seq tire son nom du amarrage d’une protéine d’intérêt pour un enzyme désaminase, suivie par l’ordinaire séquençage. Même une liaison transitoire de la protéine liée à la désaminase à l’ADN laissera une marque qui pourra être détectée dans les données de séquençage.
L’ADN est une merveilleuse molécule pour enregistrer et stocker des informations, et nous exploitons cette propriété à notre avantage. »
Dr Ivan Raimondi, biologiste moléculaire principal
Les chercheurs ont démontré le potentiel de D&D-seq en l’utilisant pour cartographier les sites de liaison de plusieurs facteurs de transcription ainsi que les protéines de remodelage de la chromatine, qui influencent l’activité des gènes en ouvrant ou fermant localement la structure tordue de l’ADN. Les démonstrations comprenaient une cartographie des sites de liaison à l’ADN d’un facteur de transcription clé dans les cellules sanguines, comparant les cellules avec et sans une leucémie commune. mutation– et permettant aux chercheurs de voir en détail comment la mutation modifie la liaison au facteur de transcription.
« Nous entrons dans une ère de médecine dans laquelle les facteurs de transcription et autres régulateurs de l’activité génétique seront de plus en plus des cibles thérapeutiques », a déclaré le Dr Landau, qui est également oncologue au NewYork-Presbyterian/Weill Cornell Medical Center. « Ce type de technologie devrait jouer un rôle important dans le développement et l’évaluation de telles thérapies. »
Les chercheurs ont montré que D&D-seq, bien qu’il s’agisse d’un travail en cours avec de nombreuses améliorations prévues, peut déjà être utilisé avec des plates-formes multi-omiques unicellulaires standard, permettant la cartographie des interactions ADN-protéine ainsi que des lectures associées des modèles d’activité des gènes, des séquences globales du génome et d’autres couches « -omiques » dans les cellules individuelles.
« D&D-seq est indépendant de la plate-forme : il s’agit essentiellement d’une fonctionnalité plug-and-play que vous pouvez ajouter aux plates-formes existantes pour obtenir plus d’informations sur vos expériences », a déclaré le Dr Raimondi.
Drs. Landau et Raimondi prévoient une large adoption de D&D-seq pour la recherche multi-omique. Ils forment déjà des chercheurs d’autres laboratoires à son utilisation et visent à commercialiser cette approche, a déclaré le Dr Landau.
Source:
Référence du journal :
Chi, W.-Y., et coll. (2026). Cartographie unicellulaire des interactions régulatrices ADN-protéine. Cellule. DOI : 10.1016/j.cell.2026.05.014. https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00573-8
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Cette chronique a été rédigée avec le plus grand soin pour rendre compte du sujet de façon fidèle. Vous pouvez consulter cet article consacré à la « chasteté » et sur le thème « d’arrêter la masturbation », publié par la rédaction de stop-masturbation.com. Le site stop-masturbation.com a pour mission de rassembler et diffuser des textes traitant de la chasteté publiés sur le web. Pour toute remarque concernant ce dossier, merci d’utiliser les coordonnées figurant sur notre site. En suivant régulièrement notre blog, vous serez informé(e) de nos prochaines publications.